水环境质量是指水环境对于人群生存以及社会经济发展的适宜程度，通常指水环境遭受污染的情况。巢湖水环境质量存在以下主要问题：由于流域人口增加过快、人多地少、导致巢湖区域大范围的生态退化以及大量营养盐的流入。毁林开荒导致了森林的覆盖面积降低，水土流失和土地沙漠化。巢湖泥沙淤积，湖泊的岸线向湖中心推移。水体富营养化速度加快。近40年来，农业的发展导致大量化肥、农药的使用，生活污水和农业污水增加，且未达标就排入巢湖。使巢湖水体富营养化加剧。巢湖闸和裕溪闸的修建使巢湖变成半封闭的较稳定的水域，改变了湖泊天然的生态系统和水文特征。降低了水体的交换能力和天然调节能力，使得湖泊的生态系统变得脆弱。外源性营养物质大量堆积，水体内氮、磷的含量有着明显的上升趋势。蓝藻类大量繁衍的同时，抑制了其他藻类的生长和繁衍。近年来，巢湖水质基本处于劣V类，主要污染物为氮、磷和水体富营养化而产生的藻类。国内外的学者都对于巢湖的污染和预防都有其自己的观点和看法。而湖水富营养化则是大家关注的重点，水体富营氧化是指氮、磷等植物营养物质含量过多所引起的水质污染现象。当过量营养进入湖泊、水库、河口、海湾等缓流水体后，水生生物特别是藻类将大量繁殖，使水中溶解氧含量急剧下降，以致影响到鱼类等的生存。在自然条件下，湖泊从贫营养湖-营养湖-沼泽-陆地的演变速度极为缓慢。而在人类的活动将大量工业废水和生活污水以及农田径流中的植物营养物质排入湖泊等水体后，水体的富营养化速度将大大加速。水体富营养化时，由于浮游生物大量繁殖，往往呈现蓝色、红色、棕色、乳白色等颜色。近年来由于巢湖污染日益加重，有机物质超标，富营养化成分高，为蓝藻的生长繁殖提供了良好的条件。20世纪80年代末，巢湖蓝藻爆发量为78万吨干生物量。近20年来巢湖蓝藻生长异常旺盛且腐烂后异常腥臭，严重破坏水质。35846
针对这一情况，国内提出以下几点整改意见：1、加大环保宣传，提高全民护水意识，2、严格控制电源污染，3、降低农业面源污染，4、疏挖污染底泥，5、加大水资源控制力度，缩短江湖水交换周期，6、投放食藻鱼，禁湖休渔，7、建立沿湖湿地生态系统，提高湖泊自我调节能力，8、加强对湖区生态环境的治理和恢复，9、把污染和经济结构调整结合起来统筹考虑。以期还巢湖一个碧海蓝天。
2.2国外
20世纪70年代末，美国环境保护局就水环境保护方面提出了更高的目标，水环境质量管理不仅要关注污染控制的问题，还要关注水环境生态系统结构与功能的保护。这意着需要一个能够反映水环境生态系统空间特征差异的管理体系，不仅能够指导水质管理，还能为水环境生态完整性标准的制定提供一定的依据。从而实现水环境生态指标管理。论文网
近十余年来，日本、美国、德国、瑞士等发达国家纷纷对以往的水环境治理思路进行反思，并提出了新的理念-生态治水，尊重湖泊系统的自然规律，注重对其自然生态系统和环境的保护，使河流的综合服务功能能更好的展现出来。 水环境保护国内外研究现状:http://www.751com.cn/yanjiu/lunwen_34000.html