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顺乌头酸酶基因的进化分析+文献综述(3)

时间:2017-05-16 21:30来源:毕业论文
2.1.2 真菌 运用DNAstar分析真菌中顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白,其数据如表2所示: 表2 真菌顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白 Table 2 Fungi aconitase gene


2.1.2 真菌
运用DNAstar分析真菌中顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白,其数据如表2所示:
表2 真菌顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白
Table 2  Fungi aconitase genes and their encoding protein
基因    染色体定位    ORF    氨基酸个数    相对分子质量    PI    分子式
酿酒酵母gi|330443681    XII c737548-735212    1-2337    778    85368.3    6.50    C3841H60555N1047O1178S26
白色假丝酵母gi|68488950    1 Ctg19-10251 13419-15794    1-2376    791    85925.3    5.60    C3812H5992N1026O1177S28
盘基网柄菌属 gi|269316126    3  c1171255-1168705    1-2343    771    83542.2    6.19    C3707H5893N1017O1125S26
戴尔凯氏有孢圆酵母 gi|367012608    3
1013104-1015473     1-2370    770    83922.0    6.03    C3716H5869N1013O1149S25
由表可知,酿酒酵母顺乌头酸酶基因定位在XII染色体上,编码区在c737548-735212,编码框在1-2337,蛋白分子式为C3841H60555N1047O1178S26;白色假丝酵母基因定位在1 Ctg19-10251染色体上,编码区在13419-15794,可读框在1-2376,蛋白分子式为C3812H5992N1026O1177S28;盘基网柄菌属基因定位在3染色体上,编码区在c1171255-1168705,可读框在1-2343,蛋白分子式为C3707H5893N1017O1125S26;戴尔凯氏有孢圆酵母基因定位在3染色体上,编码区在1013104-1015473 ,可读框在1-2370,蛋白分子式为C3716H5869N1013O1149S25;真菌中顺乌头酸酶基因编码的氨基酸个数在780左右,蛋白质等电点在5.5~6.5之间,为酸性蛋白。
2.1.3 植物
    运用DNAstar分析植物中顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白,其数据如表3所示:
表3 植物顺乌头酸酶基因及其所编码的蛋白
Table 3  Plant aconitase genes and their encoding proteins
基因    染色体定位    ORF(个数)    氨基酸个数    相对分子质量    PI    分子式
拟南芥  gi|240254678     2 2141399-2146678    32    320    36183.0    4.98    C1609H2506N420O498S15
马铃薯 gi|564112057    3.0  scf00122
c809488-807324     13    319    36386.9    5.21    C1646H2571N413O483S16
豆 gi|353336050    1, V1.1 c49188594-49180698    38    308    34844.0    5.41    C1562H2444N408O462S16
葡萄 gi|357773481    12, 12X
6307980-6312506     18    318    35915.2    5.32    C1610H2514N420O474S18
由表3可知,拟南芥顺乌头酸酶基因定位在2染色体上,编码区在2141399-2146678,编码框32个,蛋白分子式为C1609H2506N420O498S15;马铃薯顺乌头酸酶基因定位在3.0 scf00122染色体上,编码区在c809488-807324,编码框13个,蛋白分子式为C1646H2571N413O483S16;豆顺乌头酸酶基因定位在1, V1.1 染色体上,编码区在c49188594-49180698,编码框38个,蛋白分子式为C1562H2444N408O462S16;葡萄顺乌头酸酶基因定位在12, 12X染色体上,编码区在6307980-6312506,编码框18个,蛋白分子式为C1610H2514N420O474S18;植物中顺乌头酸酶基因编码的氨基酸个数在320个左右,与原核生物、真核生物中动物及真菌大不相同,可以推断植物顺乌头酸酶基因起源于与原核生物、真核生物中动物及真菌不同。等电点在5.0左右,为酸性蛋白质。 顺乌头酸酶基因的进化分析+文献综述(3):http://www.751com.cn/shengwu/lunwen_7141.html
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